Wordの印刷用ファイルから修正しても,Excelのデータには反映されません。Wordファイルを閉じて、データのあるExcelファイルを開き、行削除してからExcelファイルを保存終了して下さい。それからWordの印刷用ファイルを再び開いて下さい。
Excel側の処理を完結させてから、Wordの差し込み側を修正してください。WordとExcelによる差込印刷の手順http://kedu.kenet.ed.jp/hp/tips/tips017.pdf