私はfeedlyに切り替えているのですが。http://japanese.engadget.com/2013/03/13/google-reader-feedly-api/記事にあるようにfeedlyさんがAPI受け入れを表明しているので、全部のアプリが死ぬと決まった訳ではないようです。バックグラウンドをfeedlyさんに切り替えるアプリが出揃ってから、選んだ方が選択肢は豊富かもしれません。