Evernoteとの同期については、Wunderlistの公式フォーラムで「機能追加」として要望されています。
Sync with Evernote – Feature Requests for Wunderlist
http://wunderlist.uservoice.com/forums/136230-wunderlist-2-feature-requests/suggestions/2894694-sync-with-evernote
ユーザーのコメントを見ても裏技などでも実現できていないようなので、今後の機能追加に期待するしかないと思われます。
ご回答ありがとうございました!待つしかなさそうですね