アプリケーションが自動更新された場合、それを通知してくれるアプリがあります。その際バイブレーションも鳴ると思います。そういったアプリを最近インストールされてはいないでしょうか?「設定」→「通知」をご覧くだされば、おそらくONになっていると思います。止めたい場合はOFFにしてくだされば直るかと思います。