(1)ﾚﾝﾀﾙならば選択肢は無いに等しい｡

ﾚﾝﾀﾙｻｰﾊﾞｰではMySQLが圧倒的に多く､現状ではほぼ一択です｡
RDBMSを選択できる場合でも､情報量の多いMySQLが有利です｡
ちなみに､過去質問していたWordPressもMySQLが標準です｡

ORACLEはﾗｲｾﾝｽ料がものすごく高い…｡
Accessはﾊﾟｿｺﾝ用｡ﾃﾞｰﾀだけを使うことは出来ますが面倒です｡
SQLserverはWindowsｻｰﾊﾞｰでしか動かず､使えるｻｰﾊﾞｰが少ない｡
PostgreSQLは無料では無類の高機能ですが､使えるｻｰﾊﾞｰが少ない｡
SQLiteは無料で高速なのですがWEBｻｰﾋﾞｽにはあまり向かない｡

(2)覚えるべきはSQL｡

ﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽを操作するためにはSQLを覚えなければなりません｡
標準化が図られていますので基本構文はRDBMSを選ばず同一ですが､
関数は独自のものが多く､実装の違いで癖があったりもしますので､
MySQL向けの本を読み漁ったら良いでしょう｡

いい本を勧めてくださいという質問も多いのですが､
読みやすさは人によって違うので､私は何も推薦しません｡

(3)ｽｸﾘﾌﾟﾄ側はｺﾋﾟﾍﾟから始めれば良いです｡

phpからMySQLに接続する方法は多岐に渡りますが､
Mysqliﾄﾞﾗｲﾊﾞを選べば､ほとんどの環境で利用可能です｡
http://www.php.net/manual/ja/set.mysqlinfo.php
http://www.php.net/manual/ja/book.mysqli.php

たくさんのﾍﾟｰｼﾞを作っていく予定であれば､
ｵﾌﾞｼﾞｪｸﾄ指向型のﾌﾟﾛｸﾞﾗﾐﾝｸﾞ技術を磨いたほうが便利ですが､
旧来型の手続き型でｽｸﾘﾌﾟﾄを書き続けても特に問題はありません｡
ちなみにWordPressも手続き型を採用しています｡


XMLやJSONといった別ﾃﾞｰﾀ形式でのやり取りや､
Ajax通信なども気になるでしょうけど､後々の話です｡
まずはphpからDBを自由に操作できることを目標にして､
MySQL関連の本を片っ端からざっくりと読んでみてくださいな｡