通院中ということであれば､担当医とご相談下さい｡
どれぐらい治療を続ければ改善するのか､原因は何なのか……疑問があれば､担当医に相談するのが最善です｡担当医が一番､質問者さんの症状を把握しているのですから｡

◆円形脱毛症 - Wikipedia ：
http://ja.wikipedia.org/wiki/%E5%86%86%E5%BD%A2%E8%84%B1%E6%AF%9B%E7%97%87

本来､体の防御機能であるCD8陽性Tﾘﾝﾊﾟ球が毛根部分の自己抗原(おそらくﾒﾗﾆﾝ関連の蛋白)にあやまって攻撃してしまういわゆる自己免疫反応によって引き起こされる自己免疫疾患である｡
(中略)
現在では精神的ｽﾄﾚｽは誘因の1つではあっても主原因は体内のｱﾚﾙｷﾞｰが合併するなどによって自己免疫異常が引き起こされているのではないかと考えられるようになってきている｡また肉体的ｽﾄﾚｽ､ｳｲﾙｽ感染なども誘因の一つである｡

●ｱﾚﾙｷﾞｰ性
円形脱毛症全体の8割を占めるﾀｲﾌﾟで､他のｱﾚﾙｷﾞｰ疾患 (ｱﾄﾋﾟｰ性皮膚炎や喘息など)と円形脱毛症との合併には統計的有意差があると言われており､これらのｱﾚﾙｷﾞｰ疾患が円形脱毛症と深く関わっていると推測されている｡このﾀｲﾌﾟは発症が単発型でも次第に症例が重くなる傾向があり完治が難しいとされている｡

●非ｱﾚﾙｷﾞｰ性
ｱﾚﾙｷﾞｰを持っていない患者の場合､ｽﾄﾚｽなどによって自己免疫異常が一時的に発生して脱毛に至るのではないかとされている｡ｱﾚﾙｷﾞｰを持つ場合でもｽﾄﾚｽが引き金となり発症してｱﾚﾙｷﾞｰによって重症化する可能性も考えられている｡ｽﾄﾚｽが原因の場合はｽﾄﾚｽやﾌﾟﾚｯｼｬｰがなくなれば治癒するため短期(6ヶ月程度以内)で完治することが多い｡