注3：
2012.6に似たような質問をしております｡
http://q.hatena.ne.jp/1340848961
不都合･追加の部分を書いていただけると助かります｡
よろしくお願いします｡

こんな感じになると思います｡
f.submit() の前に､ｺｰﾄﾞを足してます｡

function checkForm() {

 var f = window.document.form1;

 ...

//ここから
 //申込
 {
 var courses = document.getElementsByName("course[]");
 var checked = 0;
 for (var i = 0 ; i < courses.length ; ++i) {
 if (courses[i].checked) {
 checked += 1;
 }
 }
 if (checked == 0) {
 alert("ｺｰｽのどれかを､最低ひとつは選んでください"); // ちょっと文言を変えてます
 return false;
 }
 }

 // 申請する/しない
 {
 var fps = document.getElementsByName("fp");
 if (! fps[0].checked && ! fps[1].checked) {
 alert("｢申請する/しない｣のどちらかを選んでください");
 return false;
 }
 if (fps[0].checked) {
 if (f.kaiin_id.value == "") {
 alert("会員番号を入力してください");
 return false;
 }
 if (! /^[A-z0-9]+$/.test(f.kaiin_id.value)) {
 alert("会員番号は､半角英数字で入力してください");
 return false;
 }
 }
 }
//ここまで

 f.submit();
}

会員番号は半角英数字のみ､とあるので､そのﾁｪｯｸも足してみました｡
ime-mode は disabled になってますが､ｺﾋﾟﾍﾟで全角を貼り付けられるので｡