Evernote、Androidアプリで注釈の書き込みが可能に
http://internet.watch.impress.co.jp/docs/news/20130906_614372.html
有料会員は、PDFにも注釈の追加が可能だそうです。
Evernoteに保存したPDFに対して、下線を入れたり注釈を付けることができます。
動作OSはWindows, MacOS, Android, iOS
http://evernote.com/intl/jp/skitch/
可能ですよ。
こちらを参考にしてみてください。
http://evernoteevernote.crowd55.com/archives/tag/evernote%E3%80%80pdf
https://blog.evernote.com/jp/2013/09/06/15061
追記しました
Evernote for Androidの注釈機能の使い方
http://tade-blog.info/smart-phone/1249/
Evernoteのpdf書類に線を引くぞの巻
http://d.hatena.ne.jp/digistill/20100304/p3
Skitchの使い方
http://evernote.com/intl/jp/skitch/guide/ios/
参考リンク
Noteshelf
http://japan.cnet.com/app/ipad/35044008/
Foxit J-Reader
http://news.mynavi.jp/news/2013/09/02/231/
http://www.foxit.co.jp/products/Secure_PDF_Reader/capabilities.html
https://www.foxit.co.jp/downloads/index.php
Nitro PDF Reader
http://www.moongift.jp/2010/09/nitro-pdf-reader/