ﾃｰﾌﾞﾙを自分自身と比較するような抽出処理を行なう場合，相関ｻﾌﾞｸｴﾘを使えば実現できます｡

※今日のﾃﾞｰﾀと昨日のﾃﾞｰﾀで同一のﾃｰﾌﾞﾙを比較対象にしている

SELECT
 名簿1.name,
 売上1.date,
 売上1.sales
 
FROM
 当日売上ﾃｰﾌﾞﾙ AS 売上1
 LEFT JOIN 
 社員名簿ﾃｰﾌﾞﾙ AS 名簿1
 ON
 売上1.item_id 
 = 
 名簿1.item_id

WHERE
 
 -- 日付が1日違いで，なおかつ金額が1000円以上異なっているﾚｺｰﾄﾞを抽出
 EXISTS
 (
 SELECT
 *
 
 FROM
 当日売上ﾃｰﾌﾞﾙ AS 売上2
 LEFT JOIN 
 社員名簿ﾃｰﾌﾞﾙ AS 名簿2
 ON
 売上2.item_id 
 = 
 名簿2.item_id
 
 WHERE
 
 -- 日付が1日違いであること
 ( ABS( DATEDIFF( 売上1.date, 売上2.date ) ) = 1)
 
 AND

 -- 今日か昨日のﾚｺｰﾄﾞであること
 ( 売上1.date = CURDATE() OR 売上2.date = CURDATE())
 
 AND
 
 -- 金額が1000円以上異なっていること
 ( ABS(売上1.sales - 売上2.sales) >= 1000 )
 
 )

ORDER BY
 社員名簿ﾃｰﾌﾞﾙ.name ASC,
 当日売上ﾃｰﾌﾞﾙ.date ASC
;

自信が無いのでｺﾒﾝﾄに書いたのですが､あまりにも見にくかったので､回答で失礼します｡
手元にMySQLの環境がないのでﾃｽﾄできないのですが､大体こんな感じでしょうか

SELECT e.name, SUM(a.sales) FROM 社員名簿ﾃｰﾌﾞﾙ AS e WHERE e.item_id IN (
 SELECT a.item_id
 FROM FROM 当日売り上げﾃｰﾌﾞﾙ AS a
 WHERE a.date = CURDATE()
 HAVING SUM(a.sales) >= ANY (
 SELECT SUM(b.sales) + 1000
 FROM 当日売り上げﾃｰﾌﾞﾙ AS b
 WHERE ( a.item_id = b.item_id )
 HAVING ( b.date = DATE_ADD(CURDATE, - INTERVAL 1 DAY) )
 GROUP BY b.date
 )
 GROUP BY a.date
)
UNION
SELECT f.name, SUM(c.sales) FROM 社員名簿ﾃｰﾌﾞﾙ AS f WHERE f.item_id IN (
 SELECT c.item_id,
 FROM FROM 当日売り上げﾃｰﾌﾞﾙ AS c
 WHERE c.date = CURDATE()
 HAVING SUM(c.sales) <= ANY (
 SELECT SUM(d.sales) - 1000
 FROM 当日売り上げﾃｰﾌﾞﾙ AS d
 WHERE ( c.item_id = d.item_id )
 HAVING ( d.date = DATE_ADD(CURDATE, - INTERVAL 1 DAY) )
 GROUP BY d.date
 )
 GROUP BY c.date
)

ﾌｨｰﾙﾄﾞのﾃﾞｰﾀ型にもよるわね｡
日付がdate型なら簡単よ｡

CREATE TABLE `社員名簿ﾃｰﾌﾞﾙ` (item_id INT, name TEXT);
INSERT INTO `社員名簿ﾃｰﾌﾞﾙ` VALUES(1001, '岡島'),(1002, '田中');
CREATE TABLE `当日売上ﾃｰﾌﾞﾙ` (item_id INT, date DATE, sales INT);
INSERT INTO `当日売上ﾃｰﾌﾞﾙ` VALUES(1001, '2014/4/1', 3000),
(1002, '2014/4/1', 2100),(1001, '2014/4/2', 3100),(1002, '2014/4/2', 1000);

SELECT b.name, a.date, a.sales, c.date, c. sales
FROM `当日売上ﾃｰﾌﾞﾙ` a
LEFT JOIN `社員名簿ﾃｰﾌﾞﾙ` b ON b.item_id = a.item_id
LEFT JOIN `当日売上ﾃｰﾌﾞﾙ` c ON c.item_id = a.item_id AND c.date = a.date -1
WHERE abs(a.sales - c.sales) > 1000;