専用のメモリカードなら簡単に移動できるようです。
http://manuals.playstation.net/document/jp/psvita/basic/internalmemory.html
本機に搭載された内蔵メモリーカードのデータを、別売りのPS Vita専用のメモリーカードに移動できます。
新しいメモリーカードを本機にセットすると、メッセージが表示されます。画面の指示に従ってデータを移動してください。移動が完了すると自動的に再起動します。
「おしえてPS Vita TV | PlayStation®Vita TV | プレイステーション® オフィシャルサイト」より。
PS Vitaとデータを連携して遊ぶ場合は、既にお持ちのPS Vitaと同じSENアカウントをPS Vita TVに登録、サインインしていただくことで、今までお使い頂いていたメモリーカードを使用することができます。
とのことです。同一アカウントであればVITAのメモリーカードがそのままVITA TVでも使えるようです。