外務省のｻｲﾄで公開されている史料では､以下のようにあります｡

当時の小笠原諸島は､ｲｷﾞﾘｽが領有を宣言したり(1827年＝文政10年)､浦賀に来航する途次のﾍﾟﾘｰが､現在の父島に貯炭地を設置する契約を島民との間に結び､かつ島民に植民政府樹立を宣言させる(1853年＝嘉永6年)など､領有権が曖昧な状態にあった｡こうした事態を危惧した幕府は､外国奉行の水野忠徳(筑後守)一行を咸臨丸にて小笠原諸島に派遣した｡1862年1月18日(文久元年12月19日)､父島に到着した水野は､父島･扇浦に幕府の役所を設置すると同時に､同諸島が日本領であることを島民に伝達して､小笠原諸島の日本領有を明確にした｡これを受けて幕府は､同年6月(文久2年5月)､各国代表に小笠原諸島の領有権を通告した｡

15. ｢咸臨丸風波ﾉ図｣

これを見るに､伊豆国の所轄ではなく幕府直轄ということでしょう｡


その後､内務省管轄から東京府へ移管です(東京都小笠原支庁のﾍﾟｰｼﾞから)｡

丈久 元年(1861年)	幕府は外国奉行水野忠徳らに命じ､小笠原調査のため､ ｢戚臨丸｣を派遣､居住者に日本領土であること､ 先住者を保護することを呼びかけ同意を得る｡
明治 9年(1876年)	国際的に日本領土と認められる｡ 内務省所管と定められ､移民を送り内務省出張所が設置される｡
13年(1880年)	東京府の管轄となり､内務省出張所が廃止され､ 東京府小笠原出張所が設置される｡

沿革｜小笠原支庁