wikipediaの英語記事を調べてみると
海軍提督を意味するadmiralが使われています
http://en.wikipedia.org/wiki/Gaspard_II_de_Coligny
He organized the expedition of a colony of Huguenots to Brazil,
under the leadership of his friend and navy colleague,
Vice-Admiral Nicolas Durand de Villegaignon,
who established the colony of France Antarctique in Rio de Janeiro, in 1555.
彼はブラジルへ向かうユグノーのコロニーへの遠征を編制した
彼の友人であり海軍の同僚であるリーダーシップの下
代理提督Nicolas Durand de Villegaignon
1555年、リオデジャネイロのFrance Antarctiqueにコロニーを確立した
コロンブスによるアメリカ大陸発見が1492年
ヨーロッパの列強国ではすでに海軍が組織されていたとしても
何の不思議もない時代といえます
ユグノー(キリスト教改革派)の虐殺はヨーロッパ各地で相次いでいたので
彼らは逃亡先にアメリカ大陸を選んだ、その指揮を執ったのが
コリニー提督の友人であり同僚でもあった人物だったという事でしょう
また、関連記述がジョゼ・デ・アンシエタにあり
http://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%82%B8%E3%83%A7%E3%82%BC%E3%83%BB%E3%83%87%E3%83%BB%E3%82%A2%E3%83%B3%E3%82%B7%E3%82%A8%E3%82%BF
フランス人移住者は、ユグノー提督代理のニコラ・デュラン・ド・ヴィルゲニョン (Nicolas Durand de Villegaignon) らに指揮されて1555年に、リオデジャネイロ付近のグアナバラ湾に移住していた。この連合は1562年から1564年の間、数回にわたってサンパウロを攻撃したが、町はこれらを食い止めた。
つまり提督とは海軍提督の意味で間違い無さそうです