役割は違わないです、むしろ同じ場所でNGOとJICAが共同して働いていることもよくあります。
ただJICAは公務員を出向させたり給料の出所が政府になっています。
そのことで有利さと制限があります。
NGOはスポンサーが引き上げたら事業中止になることがありますが
JICAはもうすこし粘る力があります。
ただし日本国政府の不利になるようなことや、
日本の法律・運用指針に背くこと、日本マスコミに報道されたら困るようなことは
死んでもできません。
それは勢いのあるNGOさんにやってくださいとお願いするしかないです。
文化祭を監督する先生とやる気のある生徒グループみたいな関係です。
基本的には同じことをやろうとしています。
JICAは日本政府のひもつきです。同様に先進国はおのおのの政府のひもつきの事業体をもっています。
NGOは民間ですが、政府から仕事を受託して行うこともあります。また、NGOの中には、日本国内に本拠地があるもののほか、日本でのグループがあっても、本拠地が外国のところ(例えば、国境なき医師団)もあります。
このような世界をまたにかける組織は、国連や国連の専門機関(ユネスコ、ユニセフなど)と共同でやったり、そこが依託している場合もあります。