補足ですが､php.iniに加え､Apacheも再起動してます｡

ｺﾏﾝﾄﾞﾗｲﾝ版とｻｰﾊﾞｰ版のPHPで､読み込んでいる設定ﾌｧｲﾙ｢php.ini｣が違うのかもしれません｡
ｺﾏﾝﾄﾞﾗｲﾝで｢php --ini｣を実行し､｢phpinfo()｣の結果の｢Loaded Configuration File｣と比較してみてください｡


･PHP: PHP 拡張ﾓｼﾞｭｰﾙの Windows へのｲﾝｽﾄｰﾙ - Manual
http://php.net/manual/ja/install.pecl.windows.php

しかし､ｳｪﾌﾞｻｰﾊﾞｰによっては少し迷うことがあるかもしれません｡ というのも､php.ini が PHP 実行ﾌｧｲﾙとは別の場所にあることもあるからです｡ 実際に使われている php.ini の場所を見つけるには､ phpinfo() で次のような行を探します｡

Configuration File (php.ini) Path C:\WINDOWS

Loaded Configuration File C:\Program Files\PHP\5.2\php.ini

上記がｺﾏﾝﾄﾞﾗｲﾝ(Cli)版とｻｰﾊﾞｰ版で異なっていた場合､ｻｰﾊﾞｰのPHPがﾓｼﾞｭｰﾙ版PHPの場合はApacheの設定ﾌｧｲﾙ｢httpd.conf｣等に｢php.ini｣の場所を指定する記述を追加します｡

PHPIniDir "Cli版のPHPが参照している｢php.ini｣のﾃﾞｨﾚｸﾄﾘまでのﾊﾟｽ"

※ﾌﾞﾛｯｸ内ではない場所に記述します｡

･php.iniの配置場所の指定(PHPIniDir)
http://www.adminweb.jp/apache/php/index3.html


CGI版のPHPの場合､本体と同じ位置にある｢php.ini｣を自動的に読み込みますので､そちらの｢php.ini｣にﾓｼﾞｭｰﾙ読み込みの記述を追加します｡
※ﾓｼﾞｭｰﾙ版PHPの場合も上記の設定を行わず､｢Loaded Configuration File｣で確認した｢php.ini｣に設定し直しても良いと思います｡
どちらでも好きな方法を試してみてください｡(どちらのPHPも頻繁に利用する場合は､同一の設定ﾌｧｲﾙを参照するようにした方がいいと思います｡)


【※ 追記 ※】

PHP実行ﾌｧｲﾙ(｢php.exe｣等)がCli版とCGI版で違う場所にある場合､Cli版やCGI版ではｺﾝﾊﾟｲﾙ後に設定ﾌｧｲﾙの場所を変更指定をする事はできないと思いましたので､｢C:\WINDOWS｣に｢php.ini｣をｺﾋﾟｰ移動(あるいはｺﾋﾟｰして元ﾌｧｲﾙは名前変更)して､同じ設定ﾌｧｲﾙを参照するようにしてみてください｡(※Cli版およびCGI版では､PHP実行ﾌｧｲﾙと同じﾃﾞｨﾚｸﾄﾘの｢php.ini｣が優先されます｡)
あるいはWindowsの環境変数を変更して､Cli版のPHPをｻｰﾊﾞｰ版と同じﾃﾞｨﾚｸﾄﾘにあるPHPを利用するようにしても良いと思います｡


【※ 追記 ※】

さらに追記します｡
｢php.ini｣の場所に問題がない場合は､｢extension_dir｣の設定値を確認してみてください｡
｢extension_dir = "ext"｣のようにﾌｫﾙﾀﾞ名だけ指定してある場合､Cli版やCGI版からは正常に使用できても､ﾓｼﾞｭｰﾙ版では認識できない事もあるようです｡
｢extension_dir = "C:\php\ext"｣のようにﾊﾟｽを指定すると正常に認識されます｡