法令の基本形式 - Wikipediaの冒頭と「本則」の項にかいてあります。
別に決まってるわけではないがデファクトスタンダードになっている模様です。
実際、章わけしてくれないと1000条を越える民法のどこからみていいかわからないですからね。
ネットに掲載する場合もたしか全部掲載されてますね。
http://law.e-gov.go.jp/cgi-bin/idxsearch.cgi
編、章、節、、、というのは、どなたが思いついたのでしょう。明治の初期の人、漢文の素養のある人だというのは間違いないと思います。
漢文のセンスの中から、ご自分で作り出したのか、あるいは、中国の古い何かに例があったのか、と思うのですが、いかがでしょう。