MindMeister(マインドマイスター)はおすすめです。クラウドなのでiPadほかいろんなデバイスと同期します。マインドマップツールとしては歴史はある方で、ユーザー数は250万くらいです。http://mindmeister.jp/http://mindmeister.jp/blog/
こちらはいかがでしょうか。MindNodeiCloud か Dropbox でデータを共有できます。