「勝手に入られる」が、なにをさしているか分かりませんが...パソコン等に接続されて、ゲーム以外のデータを見られてしまうということを言われているのであれば、すべてのポートではなく、必要な限定されたポート( 25565 ) だけを公開しているのであれば、Minecraftサーバの不具合やセキュリティホールがなければ、大丈夫ではないでしょうか。