1.一応市販のウイルス駆除ソフトを使ってスキャン&駆除した方がいいかと思われます。
2.「この接続は安全ではありません」という表示は怪しいサイトと判定された場合になることが多いみたいです。
http://security.data-site.info/620.html
ウィルス対策など使い放題(無料)わたしも昨日から使っています。
「ウィルス バスター クラウド」(P2)
20170201-0303 体験版はシリアル番号なし。
http://virusbuster.jp/vb/trial/trialthanks/trialthanks4.htm
メールアドレスだけ必要です。
単純に、最近ブラウザーが「安全でない」という判断をする基準を変えました。Chromeでは最終的に「全てのHTTPS接続でないページに安全ではない旨を表示する」という方針です。
https://japan.cnet.com/article/35095743/
Firefoxもほぼ同じ。
http://forest.watch.impress.co.jp/docs/news/1040734.html