友人が私のPC（OSはｗｉｎ９８）を使用した後「DOSKEYが組み込まれました」→不良セクタがあるという表示→システムドライブのエラーチェックから立ち上げるようになってしまいました。通常の立ち上げ状態に戻す方法はないでしょうか？

直接の解決方法ではありませんがこのページの質問1409を参照して下さい。

おそらく、何かのシステムツールを立ち上げた際に「C:￥AUTOEXEC.BAT」が書き換えられたのが原因だと思われます。

メモ帳でAUTOEXEC.BATを開き、該当箇所を削除してやれば解決すると思いますが、下手するとWindowsが起動しなくなってしまう危険性もありますのでご注意下さい。

これかなあ？

スキャンディスクを起動させない方法です。

こちらは、DOSKEY関係の解除方法のページです。

こちらに書いてある部分を少し引用して、

AUTOEXEC.BATをエディタで開き、”DOSKEY”と書かれている行の先頭に”REN ”と入れて保存

こちらでどうでしょうか？

URLはダミーです

『[スタート]

→[ファイル名を指定して実行]

→[msconfig]

→[[詳細設定]]

→「不正なシャットダウンの後にスキャンディスクを実行しない」

→[[OK]]

→[[OK]]

→再起動』

上記のことをすれば、起動中のスキャンディスクを回避できます。

でも、ある意味

「このディスクは寿命がきています」

と言っているようなものなので、

ハードディスクを買い換える事をおすすめします。