まだ情報が少ないようですが、基本的にA5404Sで再生できるモバイルムービーはCLIEに付属の「ImageConverter」を使う必要があるようです。
私は、A5402Sを使っています。
「Giga Pocket」がどのようなソフトか分かりませんが 「EZムービー作成ソフトLite」というフリーソフトで (.mpgからEZムービー.amc)へコンバートをして観覧しています。
HPに変換可能な動画リストが有るので覗いてみてはいかがでしょう。
いただいた回答からは方法がみつからなかったのでキャンセルします。
クリエは使わず、VAIO上でできればと思っています。クリエ買ったら、携帯で見る必要もないですし…。