（OSの違いだけでハードとその他環境は共通です）
他の掲示板を見るとMTUやRwinの設定値を調査した方が良いとのアドバイスがありました。
以下、質問いたします。
・2003 server のネット速度がXPより遅い原因。
・2003 server のネット速度をXPと同等以上にする具体的な方法。
No.1
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http://e-words.jp/w/E58D8AE4BA8CE9878D.html
半二重とは 【half duplex】 ─ 意味・解説 ： IT用語辞典 e-Words
NIC（ネットワークカード）の設定が
半二重になっているのではないでしょうか。
その場合、全二重に比べて通信速度が半分になってしまいます。
Intel(R) PROSetⅡなどがインストールされていれば
調整できるかと思います。
No.2
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OSによる、MTUやRwinの違い
半二重/全二重の確認ですが、HUBを使用なさっている場合はランプの色で判断する仕様が多いです。（緑/全二重、黄/半二重）
あと、私の知人のLANカードとHUBの相性なのか、Auto-Negotiationでは全二重にならず「100BaseTx Full Duplex」に指定しないとだめな事がありました。
了解です。。。
MTUやRwinの違いの方も皆様よろしくお願いします。
No.3
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２００３とXPの速度差がそこまで大きい原因は自分もちょっと思い当たりません。
稼動しているサービスの種類や数とかファイアーウォールやPCの性能などいろんな要素が想像できるのですが、はたしてどれが・・・・
おっしゃられるようにMTUやRWINの変更でパフォーマンスがよくなることがあるようです。
Xpや２００３になると、MTUやRWINも影響しますがAFDもかなり影響を及ぼすようです
このアタリの数値は、環境によってさまざまなので、takumitakumi 様がご自分で調査されるのが一番良いと思います。
一応参考になるページなどを書いておきます。
ここに↑、MTUやRWINを調整するソフトと説明があります。
こちら↑のサイトは、自動で、MTUとかMSSとかRWINなどの参考値を算出してくれるサイトです。
http://www.mnet.ne.jp/~angie/exp/ftth.html#06
ANGIE WORKSHOP - 光ファイバー（FTTH）導入記
そして、こちら↑のページは、AFDのことに書いてますので、目を通す価値はあると思います。
あまり具体的ではないのですが・・・参考になればと思います。
まずは、参考になる情報ありがとう御座います。
特に、最後のリンクにある、AFDは興味深いですね。。。
早速、調査項目の一つに加えてみます。
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MTUとRwin調整し、XPとほぼ同等のネットワーク速度が2003 server で得られました。
皆様ありがとう御座いました。
時間も経ちましたので、ここで質問を終了します。
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ご指摘の部分は確認してませんが、
OSによる、MTUやRwinが違うか？も気になっています。
この辺の情報はありませんでしょうか？
ちなみに、半二重／全二重がautoに設定されていた場合、実際どちらになっているのか調べる方法はありますでしょうか？