アクロバットリーダーで、通常どおり画像や文字を全て表示させておいて、
印刷では一部の文字や画像を印刷させないように設定をすることはできませんか？
利用者側の設定ではなく、作成者側のファイル制作時の設定方法のことです。
つまり、イラストレータでいうところのテンプレートレイヤーみたいなものです。
（別にレイヤーのようなものでなくてもいいのですが、印刷させたくない文字・画像があるだけです）
それはAcrobatだけでなく、各種サーバサイドアプリケーションのPDF生成モジュール類などでも
無理でしょうか。
（当方Acrobatを使わないので、よくわかりません。最終的にやろうとしているのはモジュール類での方です）
No.1
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アドレスはダミーです。結論から言いますと可能と思われます。AcrobatPDFを生成する過程で，AcrobatDistillerを経由します。Distillerアプリケーション上で，セキュリティを掛けることで可能です。
設定/セキュリティ
で，「AdobePDFセキュリティ」ダイアログボックス内，「権限」項目内，「印刷を許可」項目内で設定できます。
No.2
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アドレスはダミーです。（当方Acrobatを使わないので）と仰っていますので，データをWordで作られた場合のセキュリティの掛け方をお教えします。Acrobatアプリケーションは，インストールする必要があります。
データ作成後，
ファイル/印刷
「印刷」ダイアログボックス内で，「プリンタ」欄内から”AdobePDF”を選択。
その後，「プロパティ」ボタンを押す。
「AdobePDFのドキュメントのプロパティ」ダイアログボックス内，「AdobePDFセキュリティ」タブで，”各ジョブごとにセキュリティを確認”を選択。
その後，「編集」ボタンを押し，印刷に関する任意の設定をして下さい。
やはり言葉足らずでしたが、PHPのFPDFのようなライブラリ（またはPerlの）を探していまして、
印刷が目的のPDFファイルをWeb上で動的に生成したいと考えております。
例えば、IEのインラインのAcrobatReaderでの表示では印刷位置のガイドとなる枠
（あくまで例ですので、背景とページの境界線のことではなくて、当方が作成したい
色々なガイドの線や、注釈のような文字）を表示させて、
いざ印刷してもらうときに、その枠や文字は印刷されないようなPDFファイルの生成を考えています。
イラストレータの、印刷されないテンプレートレイヤーみたいな感じの実装を考えています。
No.3
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http://pac.mediadrive.jp/ypdf_s/
MediaDrive：やさしくPDFへ文字入力シリーズ TOP
やさしくPDFへ文字入力
やさしくPDFへ文字入力 PRO v.4.0
やさしくPDFへ文字入力 v.2.0
http://pac.mediadrive.jp/ypdf_s/
http://www.vector.co.jp/magazine/softnews/041009/n0410091.html
自分で使用していますが便利です。
画像のみ印刷等
SepPDF
ComPDF
http://www.ne.jp/asahi/foresth/home/
http://www.forest.impress.co.jp/article/2004/06/02/dogubako132.h...
ちょっと違うかなあ
http://support.adobe.co.jp/faq/faq/qadoc.sv?223477+002
［223477］PDF ファイルのレイヤーを表示する
PDF ファイルのレイヤーを表示する
よく見てみます。
皆さん、ありがとうございました。
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Acrobat Distillerなるものがあるとは知りませんでしたので、「サーバサイド」とひとくくりしましたが、PHPかPerlでのフリーのモジュールを希望しております。
質問があいまいで申し訳ないです。