windows2000を使っています。

Windows98(SECOND EDISTION)を使っていた時に私もHALx3さんの様にexeがほとんど起動できなくなった時がありましたが、私の場合は再起動したら普通にexeファイルを起動することが出来ました。

思い当たるプロセスを全て強制終了させても起動できないのでしたら、この方法を試してみてください。

①「スタート」→「ファイル名を指定して実行」をクリックします。

②「名前」に「mscofig」と入力して「OK」をクリックします。

③「スタートアップ」タブをクリックします。

④システム起動時に起動させないプログラムのチェックをはずし、「OK」をクリックします。

⑤Wiondowsを再起動します。

注意：「ScanRegistry」「SystemTray」「LoadPowerProfile」「internet」のチェックをはずすとシステムが正常に起動しなくなりますので注意してください。

もしこれら４つの内どれか１つでもチェックをはずしていたらシステムが正常に起動しなくなるので、もう一度、４つの内１つでもチェックが外れていないか確認してみてください。

それでもし１つでもチェックが外れているようでしたら、チェックを入れて「ＯＫ」をクリックして再起動してから、ちゃんとexeファイルが起動できるかを確認してください。

常駐ソフトは基本的なもの意外はＭＳＮくらいしか動いていないとの事ですが、もう一度、他に起動させたくないプログラムがないか見て下さい。

もし上記の方法をやってみても全く改善しないようでしたら、↑のサイトにアクセスしてから左側の【win2k カテゴリ】の「トラブル」をクリックしてから、「使用中に問題が」欄の【exeファイルの関連付けを変更してしまいました】に載っている方法を試してみてはいただけないでしょうか？

とりあえずSpybotでも入れてスパイウェア駆除しましょう。

んで、スタートアップで起動している妙なプログラムがないかチェックしてみるとか。

exeがほとんどというのはWindowsに最初からはいっているnotepadとかpaintなども含むのでしょうか？

しばらくセーフモードで使ってみて症状がでないなら、セーフモードと通常時に起動しているプロセスを比較したりドライバを検証したりできるのではないでしょうか？