サーバーにアップしてあるファイルのパーミッションって、ファイル自体に記録されているんですか？それともOSの設定ファイルのようなもので管理されているんですか？

http://e-words.jp/w/E38395E382A1E382A4E383ABE382B7E382B9E38386E3...

ファイルシステムに記録されています。ファイル自体というよりは、どちらかと言えばOSよりになると思います。

あなた、ただものじゃないですね。

http://q.hatena.ne.jp/1147939962

URLはダミーです

OSが持っています

なので、異なるOSにファイルを渡した場合改めて権限を設定しなおします。

WindowsからLinux系にファイルをアップロードするときなどにパーミッションの設定がありますがWindows側には同じ設定はありませんね？WindowsはWindows独自の設定を持っているからです。

パーミッションは、ＯＳに依存しているものです。

サーバ用途ＯＳとしてはUnixまたはLinuxが主流の昨今ですが、

それらのファイルに対するアクセス制限機能として用いられています。

windowsにもファイルに対するアクセス許可機能がありますが、

あちらはUnix系OSに習い、OSが進化する中で付加された機能です。

詳細は以下のサイトが参考になるかと思います。

http://www.kent-web.com/pubc/axsken/

パーミッションはHDDのFAT領域に記録されています。

FAT領域にはそのほかにもファイルの絶対的な位置やファイル名、ファイル容量なども記録されています。

よって、FAT領域が何らかの原因で破壊されると、ファイルそのものの実体は残っていても読み出せないといった事態になります。