サイトを作って運営するに当たって、公的な機関に届出などが必要になる例を教えてください。

公的な機関への届出は特に不要だと思いますが、例えば、

○ドメインを取得する場合

　http://www.onamae.com/

○SSLサーバー鍵を使用する場合

　http://www.verisign.co.jp/server/

○あとは回線やサイトスペースを間借りするのであれば、それぞれのISPへの申請でしょうか？

　一般に音楽を流すなら、ＪＡＳＲＡＣに申請が必要です。

http://www.jasrac.or.jp/

　もっとも著作権者ならその限りではありませんが。

映像や音楽を配信する場合は、JASRACへの届けと、著作権使用料の納付が必要です。

http://www.jasrac.or.jp/network/

音楽を扱う場合だとJASRACです。

http://www.jasrac.or.jp/network/

映像の場合、著作権が複雑なのでそれにいちいち許可を取るのは大変かと思いますが。

こちらのQ5は発注者がネット配信を行う場合ですが、それでも色々面倒なようです。

http://www.eibunren.or.jp/order/q_a.html

http://howto.pimp.fc2.com/02-01-eizo.html

商業的なアダルトサイトを運営するには届出が必要になります。

音楽・映像うんぬんの情報を求めているようなので、趣旨がちょっと違うかもしれませんが。。

そのサイト内で、中古品を販売したり、オークションしたりするなら、古物商許可が必要になります。

古物商許可は、営業所の所在地を管轄する警察署の防犯係で許可申請できます。

私の友達に、ネットショップで古着のリメイク販売している子がいますが、この許可を取ったと言ってました。

http://www.kobutsushou.net/

http://www.oooka.gs/kobutu/

収入が得られるサイトであれば、確定申告が必要になってきます

http://q.hatena.ne.jp/1153455864