日本一のアフェリエイト業者は「バリューコマース」と聞きます。

大手と言えば、

アフィリエイトのA8.net

リンクシェア アフィリエイト【PC・携帯対応】

自社だけでやっているので方向性が違いますが、amazonも間違いなく大手ですね。

Amazonアソシエイト・プログラム

http://www.customclick.ne.jp/

カスタムクリックというアフリエイトです。

割と有名ではないでしょうか。

http://www.a8.net/

Ａ８ネットもかなりの有名なところです

https://www.d-064.com/touroku/han_touroku_regist1.php?hid=5779

それから電脳卸も忘れてはいけないですね

http://okozukai.toriweb.jp/hp.htm

大手アフィリエイトサイトです。

http://affiliate.rakuten.co.jp/楽天アフィリエイト

http://www.a8.net/

A8.net

バリューコマース（売上40億円）に続くのは

ファンコミュニケーションズ

売上42億円

http://www.fancs.com/

アドウェイズ

売上35億円

http://www.adways.net/

インタースペース

売上14億円

http://www.interspace.ne.jp/

といったところです。

アフィリエイト専業でなければ、下記の企業も対象となります。

サイバーエージェント

売上432億円

http://www.cyberagent.co.jp/index.html

サイバーコミュニケーションズ

売上403億円

http://www.cci.co.jp/

GMOインターネット

売上370億円

http://www.gmo.jp/

デジタル・アドバタイジング・コンソーシアム

売上253億円

http://www.dac.co.jp/

オプト

売上166億円

http://www.opt.ne.jp/

セプテーニ

売上147億円

http://www.septeni.co.jp/

まぐクリック

売上74億円

http://www.magclick.com/

トラフィックゲートも大手として挙げられると思います。

http://www.trafficgate.net/

これを見てください。↓

http://www.flickr.com/photos/toshikun/sets/72157594310679858/

携帯業界では

「Smart-C」

http://smart-c.jp/index.html

「ポケットアフィリエイト」

http://smaf.jp/

「アフィリア（affilia）」

https://www.afla.jp/welcome.jsp

などが有名ではないでしょうか。

あと最近、｢girls walker.com｣運営の

「アフィリエイトwalker」がスタートしました。

http://afw.gw.tv/afw/welcome.jsp