MSN　LIVE　MESSANGERとWindowsXPの環境にて、

LIVE MESSENGER に限らず、スタート時に沢山のアプリケーションが起動するシステムの場合、右下にアイコンが表示されないことがあります。（一度に複数のアプリケーションがタスクバーに格納する処理を行うと、そのいくつかが処理されないようです。Ｗｉｎｄｏｗｓのバグです）

まずは、タスクマネージャを使用し、LIVE MESSENGER を終了させます。（タスクマネージャのプロセスのタブより実行）

終了後は、再度LIVE MESSENGER を起動することが可能なので、スタートメニューなどから普通に起動。

起動後にオプションで、起動時にLIVE MESSENGERを起動しないように設定を変更する。

（MSCONFIG.EXEを使用してもいいかも知れません）

これで、再起動してもLIVE MESSENGERが起動されなくなります。

次に、LIVE MESSENGERをＯＳ起動後に起動されるように設定を行います。

StartupEXなどのフリーソフトを使用します。

http://www.vector.co.jp/soft/win95/util/se048060.html

３０秒程度他のソフトと間隔をあければ大丈夫かと思います。

これをスタート時に起動するようにすれば、ＯＳが安定動作した頃にLIVE MESSENGERが起動するため、タスクバーにも表示されるようになると思います。

また、これを機会に、他のソフトもスタートアップを時間差で起動するようにすると、結果的にＯＳの起動時間の短縮にもつながることもあります。