HTML_QuickFormクラスの$form->addElementでselectを指定し、テンプレートでそのドロップダウンリストが選択されたらJavaScriptの関数を起動させたいのですが、可能でしょうか？

arg5にonfocus/onblurを以下のようにして設定します。

$data = array('','','' ...);←選択するデータ

$others = arrray(

'onfocus' => 'javascript:some_js_function_1()',

);

$form->addElement('select','name', 'label', $data, $others);

これで生成されるHTMLが

<select name="name" onfocus="javascript:some_js_function_1()">

のようになってくれるので、あとは別途Javascriptの関数をどっかに書いておけばOKです。