さくらの専用サーバを契約しました。

NEC Express5800 i110Ra-1h(06-03)
上記スペックで、サーバOSはcentos、現状でwebminにログインできる状態です。
apache、BINDDNS,MySQL、sendmailなどがインストール済みのようです。
パッと見たところProFTPdやwu-ftpdなどは見当たりません。

FTPクライアントソフトを使って、サーバにファイルをアップロードしたりしてウェブページを公開したいのですが、手順がよくわかりません。本当は自分で調べて覚えたいのですが、どこから手をつければ良いかわからないので質問しました。
現状やりたいことは、
・VALUEDOMAINなどで取得したドメインを当てる
・FTPクライアントソフトでつないでファイルのやり取りを可能にする
・ページ閲覧できるようにする
・CGI、SSIを利用したい
・あわよくばメールも利用したい

以上です。
上記の項目を可能にするための大まかな流れと、
各項目についての具体的な手法を知りたいです。
よろしくお願いします。