少し質問を狭義に捉えて、クライアント端末で使うアプリに限定してみました。
Microsoft Office -- OpenOffice
iTunes --- Songbird http://www.songbirdnest.com/
MSN メッセンジャー --- aMSN http://www.amsn-project.net/
S-PLUS --- R http://www.r-project.org/
サーバ用途のアプリケーションならたくさんありそうです。
月並みですが、
http://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%82%AA%E3%83%BC%E3%83%97%E3%83%B...
に以下のような分類で主要なオープンソースソフトウェアのすべてとそのダウンロード先リンクが整理されています。( )内は私が追記したものですが、対応しそうなメジャー系Windowsアプリケーション名を記しておきました。ご参考になれば。
世界で広範に普及しているオープンソースソフトウェア
4.1 オペレーティングシステム (Windows OS)
4.2 デスクトップ環境 (Explorer)
4.3 ウェブブラウザ (Internet Explorer)
4.4 HTMLレンダリングエンジン (IExplorerOCX)
4.5 メーラー (Outlook Express)
4.6 スケジュール管理 (Outlook)
4.7 オフィススイート (Office Word/Excel/Powerpoint)
4.8 テキストエディタ (メモ帳)
4.9 ファイル差分・統合 (-)
4.10 アーカイブ (-)
4.11 ドライブ暗号化・複合化 (-)
4.12 画像編集 (Photoshop/Illustrator)
4.13 音声プレイヤー (Windows media player)
(以下略)
上記以外では、著名なオープンソース開発者向けのデータベース:
http://sourceforge.net/softwaremap/ で探してみると、市販されているソフトに類するものは大概見つかると思います。
URLのコピペですが…いかに結構な量のオープンソースのネタがまとまってます。
ツール系から制作系、サーバー管理系のものもいろいろあるようです。
http://tools.rightclicksright.net/tag/OpenSource%e3%80%80%e3%83%...
思ったものとは違いますが、これはこれで面白いですね。ゆっくり見てみます。
リスト作成ありがとうございます。Windowsアプリとオープンソースアプリを一対一に並べたリストをどこかで見たのですが、どこだったか思い出せなくて。どこだったかなあ。