大変初歩的な質問ながらしつれいします。Apache、Tomcat、MySQL、PHPの環境をととのえる時に、FreeBSDとFedoraのどちらでも、不都合はないというものなのでしょうか。多少はOSの違いによって何らかの制限というものはあるものなのでしょうか。初歩的な内容ですがご教授おねがいします

特にどのOSを使っているから動かせないとかはありません。

少なくとも初心者が分かる違いはありません。

あるとしたら情報の量と質がOSによって違ってくるので自分に必要な情報が得られるかどうかという観点で調べてみるといいでしょう。

基本的な部分で設定の差は無い。

ただし、以下の２点については注意が必要。

１．Tomcat(java) について

FreeBSD では JDK/JRE は Sun 純正のものは提供されていません。

Linux 版をエミュレーションして動かすか、FreeBSD 版が別で提供されているのでそちらを使うかです。

基本的には互換性に問題はないはずですが、細かい部分で挙動に差が出る可能性はあります。

２．MySQL について

MySQL はマルチスレッドで動作します。

過去のバージョンの FreeBSD ではスレッドの性能が良くなかったため、動作には問題ないが性能が出ないという現象がありました。

最近のバージョンでは改善はされていますが、まったく同じ性能というわけではありません。

どちらも小規模なアプリケーションでは問題にならないと思いますが、ある程度チューニングが必要なレベルになると注意が必要です。

（不向きという意味ではありません）

BSDとLinuxなら特に気を使うことはありません。

そこにWindowsが入ってくるとApacheとPHPに関しては設定やコーディングに注意が必要になってきます。

特に PHP では Windows 環境では違う動作をする関数などもたくさんありますので。