事例は日本国内限定でお願いします。
また、特許料ではなくても、そのビジネスモデル特許に従った「システムの開発・構築」とかで儲けている事例でも構いません。
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大手の事例です。
有力地銀の静岡銀行（http://www.shizuokabank.co.jp/）は5月16日，法人向けの新しい入金照合サービス「マッチングナビ」を開始した。このサービスは，銀行に振り込みをする顧客ごとに「仮想口座」を用意して，受け取り企業の入金確認業務を効率化するもの。仮想口座を使う振り込み処理の仕組みについては，三井住友銀行（当時は住友銀行）が昨年2月にビジネスモデル特許を取得している。静岡銀行は今年2月19日に，住友銀行とこのビジネスモデル特許の実施許諾契約を結び，今回のサービス開始にこぎ着けた。国内の金融機関同士が，ビジネスモデル特許の実施許諾契約を交わし，実施に至ったのは今回が初めて。
住友銀行が取得したビジネスモデル特許の名称は，「振込処理システム」（特許番号は第3029421号）。住友銀行は1999年3月から，この特許内容の仕組みを採り入れた入金照合サービス「パーフェクト（http://www.smbc.co.jp/hojin/eb/perfect/）」を開始している。そのため，このビジネスモデル特許は通称「パーフェクト特許」と呼ばれている。
静岡銀行は2000年夏頃から，新しい入金照合サービスを始めるためのシステム開発の基本設計に着手した。その過程で，住友銀行が持つビジネスモデル特許に目をつけ，仕組みに採り入れる検討を開始。住友銀行との交渉を進め，今年2月の許諾契約に至った。
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「振込処理システム」って詳しくは知らないのですが、確かビジネスモデル特許として有名なものですよね。ライセンシングもされていたんですね。
参考になります！