サイトを作る際の文字コードとドキュメントタイプはどうしていますか？

できるだけ XHTML1.1 でやろうとしています。

従って、エンコードは UTF-8 です。

メインはPHPなのですが、正規表現がperl互換で使えるのもそうしている理由です。

PHP の時も、他の時もできるだけ　UTF-8 にしています。

OS のエンコードが UTF-8 でない事があるので、そのマシン上で読もうとすると文字化けする事がありますが、複数のエンコードに対応したエディタを使うことで対応しています。

環境によってはDBを使う際に、エンコードに気を使う必要があるかも知れませんが、そのうちみんなUTF-8になっていくのだろうと予測しているので、諦めています。（そのうち気を使わなくてもよくなると思っています）

エンコードを統一していない場合は、直接そのファイルを読み出すような事をしないで、スクリプト等でエンコードを変換してから出力しています。

問題が発生するのかはチョッと不明ですが、問題になる場合（フォント名に漢字を使っているとか）もあるでしょうね。

php5 + sqliteを多用しますが、最近流行りのajaxは基本的にUTF-8でないと動きません。

また、サーバーに良く使われているCentOSなどのlinux系統も以前はEUC-JPでしたが、最近はUTF-8が標準だと聞いた事があります。

私のやり方はHTMLは共通でXHTML 1.0 Transitional、文字コードはどんな時でもUTF-8です。

私もできるだけXHTML1.1、UTF-8にするようにしています。

システムはUTF-8かEUC-JPですね、DBを使うときはなるべく文字コードを合わせます。SJISは使いません。（5Cとか5Cとか…）

cssで「@charset "EUC-JP";」と書かれたファイルを、sjisで書かれたa.htmlから読み込んでも問題ないのでしょうか？

@charsetはcssの文字コードなのでSJIS、UTF-8のHTMLで使用しても問題ありません。

プログラマとコーダーなどが別々に作業をしている「会社」ではどうしているかも気になるのでお願いします。

eucだとwin ieでソースを見た場合に文字化けしたり、メモ帳でパパッと修正もできないので嫌われていますが...

そもそもコーダーはメモ帳よりもコーディングに向いたエディタを使用していると思います。

その場合大抵SJIS、EUC-JP、UTF-8には対応している筈です。でも、勝手に変えられたら困るので文字コード（BOM有る無し）はいつも伝えます。

あと、弄りやすいようにSmartyなんかで出力文字コードにしたテンプレートを用意するようにしています。

全部、UTF-8で統一しています。

MySQLを使っています。

その際は、このクエリ $con->exec("set names utf8"); が欠かせません。