フォーマルな場ではあまり使わないほうがいいです。
俗語ですし、元々「紐付き」から派生した表現のような気がしますのでそうだとすると下品でマズいです。
情報関係ではそうでもないですが、一般には「紐付き補助金」等マイナスの印象があるときに使う言葉に思えます。
http://dictionary.goo.ne.jp/search.php?MT=%C9%B3%C9%D5%A4%AD&kin...
「ひも付ける」という表現はSEさんなどが使う業界用語です。
http://www.ne.jp/asahi/music/marinkyo/parolo/komputilo.html.ja
辞書にも載っていませんから、一般の人には、まず通じません。
無駄な誤解や疑問を生む表現ですので、出来るだけ使わない方が良いと思います。
私なら「ひも付ける」と遠回しに表現するよりも、
たとえば「関連付ける」と目的を明確にして言い換えてみたり、
たとえば「通し番号をつける」と「ひも」に相当するものを具体的に言うようにします。
「俗語」「派生語」だから「下品でまずい」という根拠を教えてください。