あるサイトを作り、丸々sslが効く様にしました。

(言い方が違うかな...!?)
要するに全ページ「https」のURLになる様にしてあると言う事です。
どのページも「http」でアクセスすると「https」にリダイレクトします。

Googleでは全てのページがインデックスされましたが、
Yahooはトップページのみしかインデックスされません。

Yahooは「httpsで始まるURLはトップしかインデックスしない」
と言うような事はあるのでしょうか？
ちなみに完成後３ヶ月以上経過しています。
また、Yahooカテゴリにも登録しています。

詳細が書かれたページもご存知でしたらURLを教えてください。

よろしくお願いします。