日本の河川や湖沼はおおむね濁っていると思います。

緑色や土色だけでなく石鹸色だったり。。。

この濁った水を透明な水にする手段は、何かないものでしょうか？

飲めるまでいかなくとも、普通に全身浸かって泳げる水質にはならないものでしょうか？
(埼玉県の上田知事は、埼玉県の河川をきれいにするプランをたてたそうで...しかし今のところまだ進捗具合が見えないように思います。
徹底的にきれいな水辺環境の街にすれば、エリアの人気も上がりますから経済的にも良好でしょう。土地区画整理事業に近い効果も期待できそう。)

河川や湖沼を浄化する方法で、実用的かつ面白そうなものはありますか？
原則として岸や陸地を使用せず
水や底に埋めたり置いたり浮かせたりする方法で、何かないでしょうか？

たとえば、川底に重しをつけた草を植えつけてEM菌を撒く、
魚籠を川に埋めて、魚が入るかわりに水草やわらを詰めてフィルタがわりにする、
タワーのようなコンクリートの構造物を川に設置して上から流し、砂を詰めて緩速ろ過する、など。
動力源の確保や洪水等を考えなければ出来そうに思いますが・・・

URLまたは内容をご教示下さい。
宜しくお願い致します。