Webページの文字列をJavaプログラムを使ってコピーしたいのですが、AJAXで生成されている文字列のためhtmlコードから見つけ出してコピーするということができません。AJAXを遡って、直接文字列を渡してもらうということもできないようです。

参考になると思います。

http://www.itmedia.co.jp/enterprise/special/0712/summary20/

こんなソフトもあります。

変換マイスター　http://www.anchorsystems.jp/

●選べる入出力

入出力は単一ファイルだけでなく、フォルダ内の複数ファイル、クリップボード、FTPサーバーなどからデータを取り出して加工・変換します。入力データは、Oracle、Microsoft® SQL Server、MDBファイル他、任意のデータベースから取り出すことも可能です。

●選べるフォーマット

入出力のフォーマットは、CSV/TSV(コンマ/タブ区切り)はもちろん、固定長データも簡単に使用できます。その他、自由形式テキスト中のEメールアドレスやURL、任意のパターンに一致した部分の抽出機能もあります。

そのjsファイルを見てもどういう処理がされてるのかよく分かりませんでした。

ご自身で調査＆勉強してもらうしかないと思います。Cookieについては私の想像の域を出ない話なので、必要かどうかも含めて調べて下さい。

なお、ネガティブ意見で申し訳ありませんが、私がその証券会社からWebサイトの開発業務を請け負ったとしたら、外部スクリプトでデータ収集／解析されないような仕組みを導入するでしょう。

前回質問で「Web画面の解析でリバースエンジニアリングが適用された事例は聞いたことがありません」と回答しましたが、自社のデータを勝手に二次利用されることは営業上好ましいことではありません。そこで、何らかの複製＆流用防止策を講じます。

クライアントPCのキャッシュを解析するという方法もありますが、JavaScriptソースが暗号化されていると、この手も使えなくなります。

そして、二次利用したい方には、それなりの価格で専用アプリを提供するか、月額幾らかを徴収するオプションサービスにするでしょう。