はてな記法を補助する機能についての質問です。

greasemonkeyやブックマークレットではクリップボードを扱えません。

userChrome.jsというアドオンを使えばできます。

が、FireGesturesというマウスジェスチャーを使えば簡単にできます。

//選択した文字列をはてな引用記法に加工してコピー
var selectText = FireGestures.getSelectedText();
if(selectText) {
	selectText = ">>\n" + selectText + "\n<<";
	putClipboard(selectText);
}
function putClipboard(string){
	Cc["@mozilla.org/widget/clipboardhelper;1"]
		.getService(Ci.nsIClipboardHelper)
			.copyString(string);
};

FireGesturesをインストールしてこのスクリプトと対応するジェスチャーを登録すれば使えます。

FireGestures :: Firefox Add-ons

いきなりのマウスジェスチャーの提案に戸惑うかもしれませんが未体験なら一度ためしてみてください。