.htaccessで下記のようにして、

ページ内リンクはブラウザが処理を行います。たとえばブラウザが

http://example.net/hoge/#test

というURLにアクセスすると、サーバは/hoge/というコンテンツを返し、ブラウザが <a name="test"> という要素まで画面をスクロールします。

なので、mod_rewriteでこれを実現するためには、ブラウザに302ステータスを返して、ページ内リンクを含んだURLに再度アクセスさせる必要があります。

mod_rewriteで、HTTPステータス 301 を返すサンプルが以下のページにありました。

http://tech.bayashi.net/svr/doc/apache/mod_rewrite.html

この手法で、恐らくブラウザにページ内リンクを含んだURLにアクセスさせることができるはずです。(ただし未検証です)

ただ、この手法は外部リダイレクションを用いているため、リダイレクト後にブラウザに表示されるURLは、元々ブラウザがアクセスしたURLではなく、リダイレクト後のものになる、という副作用があります。

ご参考まで。