【認定こども園と縦割り行政】

認定こども園は、従前は学校法人会計基準と社会福祉法人会計基準の双方の作成を求められていました。
私はこれは「縦割り行政の弊害の最たる例」と思っていますが、そうじゃない、という反論を
自分の掲示板で受けました、

皆さんどう思われますか？
認定こども園の経緯に詳しい方の解説をお待ちしています。
http://d.hatena.ne.jp/itarumurayama/20100202
の論争を参考にして下さい。