ガンプラなのですが、自分は　全塗装した　あとに　スミ入れをしていますが、

ガンプラのパネルライン（というか筋彫り線）に色を入れたいと言う風に解釈しますネ。

この場合は、下記製品が使えます。

http://www.mr-hobby.com/cgi/goods.cgi?category=5

このなかの、スミ入れ用が該当します。

端的に言ってしまえば事務用品店でも扱っているミリペンですが、ガンプラ専用カラーですからこちらのほうが良いでしょう。

使い方は、ラインに沿ってペンで書き込んでゆきます。

はみ出した場合は、ティッシュなどで拭き取るか、消しゴムなどで擦り取ることも出来ますよ。

モールドの凹部に陰影をつける墨入れの場合は、リアルタッチマーカーを使うか（使用方法の簡単な説明は、上記リンク先のｐｄｆダウンロードに記載があります）

マーカー類を使わないで墨入れをするならば

用意するものは

エナメル系塗料（タミヤエナメルや入手しづらいですがハンブロール等）

画材店で扱っている油彩用のペトロールかホームセンターで入手出来るテレピン油

細筆

綿棒

ティッシュペーパー

塗料皿

使い方

塗料皿に、エナメル塗料を少量出します。

ペトロール溶剤・テレピン油などで薄めます。

ランナーなどに試し塗りして、塗料が隅に溜まる程度に薄まるよう調整します。

調整できた塗料を筆に含ませて筋彫り線に乗せるように置くと、塗料が線に沿って流れ込んでゆきます。

はみ出すような場合は、乾燥するまで待って、溶剤を含めた綿棒で拭き取ります。

モールドの凹部に影を入れたいような場合も同じように、凹部に筆をおくと塗料が窪みに沿って流れます。（流れないようなら、凹部に沿って筆で塗ってもＯＫ）

余分な塗料や、筆をはみ出した場合は、溶剤を含めた綿棒で拭き取ります。

ただ、エナメル系溶剤がプラスチックを劣化させる傾向があるようです。最悪の場合はパーツが割れることもあるようです。

ご注意ください

以下のページに詳しく説明されているのでお勧めです。

http://www.1mokei.jp/html/work_33.html

方法そのものは上のお二人の回答でいいと思います。

溝の中の塗料までふき取っているようなので、線の上をこするのではなく面から溝方向に溶剤を含ませた綿棒をこすっていくのがコツです。

綿棒の溶剤はなるべく少なくしてください。面の部分にはみ出した塗料がぎりぎり溶けだすくらい。