●事象

A（ラピッドサイド）に対してFTPログイン
ルータ非経由（直接PPPoE接続）：FTPログイン可能
ルータ経由（PPPoE接続）：FTPログイン不可　…　問題！
B（さくらインターネット）に対してFTPログイン
ルータ非経由、経由のどちらでもFTPログイン可能
●メッセージ
【ラピッドでログイン可のケース】
C:\>ftp <FTPサーバIP＞
Connected to <FTPサーバIP>.
220-
220-####################################
＜割愛：テキストメッセージ＞
220-####################################
220-USER : ＜ユーザID＞
220-PASSWORD : ＜パスワード＞
ftp : ＜ログインできました＞
【ラピッドでログイン不可のケース】
C:\>ftp <FTPサーバIP＞
Connected to <FTPサーバIP>.
220-
220-####################################
＜ここでなにも応答がなくなる＞
●環境
WAN：FLETS ADSL 8M
ルータ：コレガCG-BARFX3
FTPクライアント：FFFTP（PASV有/無）、WindowsXP標準FTP（cmd実行）
●質問
サーバ会社にもメーカに確認しても原因がわからず終いです。
根本原因がわからないとルータを買い換えても同じ問題が発生する可能性があり、非常に困っています。
考えられる原因についてご教授をお願いいたします。