iPhotoに読み込んだ動画を圧縮したいです。

デジカメでとった動画をMotionJPEGのAVIのままiPhotoに取り込んであります。
これをすべてH.264のAVIもしくはmp4に変換したいのですが、
一括で行うソフトはないでしょうか。
macbook airをメインとして使っています。
現在iPhotoライブラリが30GB以上あり、
大きな原因となっているのが低圧縮率の動画たちです。

Originalsフォルダの中のファイルを
直接HandBreakにかけたのですが、
上書き保存をしてくれないので別ファイルが作成されてしまい、
iphotoで引き続き管理することができません。

Originalsフォルダの中の動画を、
ファイル名・拡張子・タイムスタンプを変えずに
圧縮して上書き保存するようなソフトは
存在しないものでしょうか。