GPLでライセンスされたOSSソフトウェア(仮称:Aソフト）に、サードパーティーのモジュール群を開発しました。このモジュール群をバイナリで配布（リバースエンジニアリングも不可）したいのですが、GPL条項によると、動的/静的にリンクするプログラムもまたGPLでライセンスする必要があるとなっています。

パブリックドメインにして戴いて下さい．

モジュールという表現が若干曖昧なので明確な回答はしかねますが、モジュールを呼び出す側がGPLであるなら、基本的にはAのライセンスをGPLでないものにすることはできないのではないかと思います。要するにモジュールなどとしてリンクする場合はGPLにすること、というのが基本的な方針だと思いますので…。

GPLのプログラムからforkなどでGPL外のプログラムを呼ぶことは認められています(GPL FAQをご参照ください)が、これは元のプログラムと呼び出すプログラムが完全に独立している場合であって、DLLなどのように特定のAPI仕様に従ったものを作る場合にはGPLにせざるをえないと思います。

モジュールをただ単なる実行形式にして、コマンドラインなりから普通に利用できる形にする。

あらたに、指定したプログラムの結果を返すだけのモジュールを開発。

こうすることは駄目なのでしょうか？

簡単に言ってしまえばラッピングしてしまうってことで。

AソフトをLGPLにかえてもらう

そもそも

「GPLを適用したプログラムに動的にリンクするプログラムは、GPLの制約を受けるのか否かについての解釈も明確になっていない」