ウェブ制作について無知の知人に、サイトの削除を頼まれました。

.htaccessにindex.phpをトップページとして参照する記述があるのではないでしょうか？

DirectoryIndex index.php　みたいに書いてあるとか。

index.cgiやindex.phpをトップページにする方法

これが参考になるかも

あなたがindex.htmlを設置した、トップディレクトリだと思ってらっしゃるそのフォルダに、.htaccessを置いて下さい。

一番シンプルに、

DirectoryIndex index.html

と記述しましょう。

現在は

DirectoryIndex index.php

がさらに上位の方から効いている可能性があります。

もし、.htaccessを置く方法が分からないなどであれば、逆にインデックスファイルとして

index.htmlではなくindex.phpを置いても良い。

Not Found

The requested URL /index.php was not found on this server.

は出なくなります。

ftp でアクセスしたトップディレクトリが "aaa.example.com/" で、そこにある aaa は "aaa.example.com/aaa/" にあたる場所という可能性はないでしょうか？

• 今の状態（/aaa/index.html がある状態）で aaa.example.com/aaa/index.html にアクセスしてみる
• トップディレクトリに index.html を配置して aaa.example.com/index.html にアクセスしてみる

と、状況がつかめるかもしれません

また、"aaa.example.com/" ではなく "aaa.example.com/index.html" にアクセスしているのであれば、DirectoryIndex の設定に関わらず index.html が読まれるはずです。

http://aaa.example.com/ と、

http://example.com/aaa/ は同じですか？

これが同じだと仮定して話をします。

http://example.com/ に.htaccessが設置してあって、

そこに「index.html とアクセスされても、index.phpを表示させる」設定が書いてあると思います。

.htaccessが存在してないのであればサーバー側で設定してあるので設定を変える事はできません。

※ftpソフトによっては.htaccessファイルを表示させないので表示させるソフトを使ってください。

http://aaa.example.com/index.html が 表示されないのであれば、

.htaccessがあっても、いろいろな書式が考えられるのでどういう風に書いてあるのか説明できません。

これに、DirectoryIndex は関係ありません。

以上の状況が考えられますので、下記の１か、２の方法を試してください。

１）http://example.com/aaa/ に.htaccessを設置する。

RewriteEngine On

RewriteRule ^.* index.html

これで、どんなアクセスでもindex.htmlが表示されるはずです。

２）http://example.com/aaa/index.html をhttp://example.com/aaa/index.php にする。

先に、回答されてましたが、ファイル名を「index.php」にしても表示自体に問題はないので、

index.html をindex.phpに名称変更してください。

多分これが一番簡単なはずです。