高1男子です。

相手が動作の起点で、あなたが受け取る場合は
「あっどーも」
くらいでいいとおもいます。（意味は「ああ、どうもありがとうございます」または「記入に夢中で回収タイミングに気づきませんでした。お手をわずらわせてどうもすみません」。意味を両方こめられますので、便利です。）
相手によばれるたびいちいち「すみません」ではちょっと丁寧すぎるかと。（あとあやまりたくなるほど気づかないのかと）
しかし逆に相手がなかなか回してくれないときは「あーすみません…」
（意味は「すみませんが、先生がもう回収するといっているので、早くあなたの分を僕にわたしてください」）
などもいいかもしれません。動作の起点がどちらであるか、シチュエーションによってつかいわけてください。

別に「すみません。」でも敬意を払っていますんでかまわないとおもいますが、高校生なんだし、「あ、ごめん」で良いと思いますけどもね。
僕の場合もそうでしたよ。
相手も理解してくれましたから。