今エイプ50に乗ってるんですけど、最近走ってるとエンジンが空回りしたり気温や湿度のせいか分かりませんがなかなかエンジンがかからなかったりしたので自分でエアスクリューとアイドリング調整ネジをセッティングしたんですけどそしたら初速が結構速くなって最高速度は以前と変わりはないのですがエンジンの回転が上昇して車体がすごい揺れたりエンジンが焼ける匂いがしたりエンジンあたりから煙が出てきます。このまま乗っていても大丈夫でしょうか？ちなみにキャブはPC30とのっていました。

エアスクリューはアイドリングとごく低速時のガス量を調整するだけなので、アクセルを少し開けた時点で関係なくなります。
アイドリング調整ネジは、その通りアイドリングの回転数を決めるだけの事なので、これもアクセルを開けた段階で何の関係も無くなります。

初速というのは走り出しの事ですか？
アイドリングの回転が上がっていれば、それは最初からアクセルを開けているのと全く同じ事なので、クラッチミートした時に飛び出すのは当然の事です。アクセルを開けた状態で固定されたようなものです。
エンジンの回転が上昇して、というのはアイドリングの事ですよね？アイドリング調整ネジで回転を上げたのだから当然ですね。
車体が揺れる？そこまで回転数を上げたら上げすぎ、というかアイドルスクリューでそこまであがるかなぁ？
エンジンが焼けるというか、オイルの焼ける匂いですね。そりゃ、車体が揺れるほどアイドリングを上げればあちこちにじんだオイルとか色々焼けて、止まっているから匂いもするでしょう。煙もオイルが燃えているんですね。普通は煙までは出ませんね。どっかオイルが漏れている。にじむ量が多い。

もちろん、そのままではマズイでしょ。
セッティングどころかいじり壊しになってます。
アイドリング回転数はなるべく下げる。安定して回転するギリギリまで。
エアスクリューは戻し回転数がマニュアルに載ってます。
軽く締めた段階から1～3回転ぐらいの範囲のはずです。
基本はそこで、ずらしても半回転ぐらいが限度。
あまり回さなければならないなら、それは他がおかしい。

エンジンが空回りするの意味がはっきりできませんが、文字通りであればクラッチの滑りであり、ケーブルの調整をして、でも、普通は滑り出したら直ったりしないのでクランクケースを開けて交換するしかありません。
よく、すぐに切れるようにケーブルの遊びをあまり取らない人がいるけど、これは常にケーブルが張っている、クラッチが切れかかっているいる状態なので半クラで走り続けているのと同じ事です。それならすぐにクラッチはだめになります。

エンジンがかかりにくいのは、寒いから仕方ない。チョークの最適位置を見付ければ、正常なら数回でかかります。