IKEA 無印のような　家具を扱っているお店（家具専門店でなくてOK）

ファニチャードーム
http://www.furnituredome.jp/

TWO ONE STYLE
http://www.21style.co.jp/

ニトリはいかがですか？
http://www.nitori.co.jp/

島忠はホームセンターの中では家具の取り扱いは多いです。
食品スーパーとの複合店舗もいくつかあります。
http://www.shimachu.co.jp/shop/tokyo.html

ニトリ

unicoの家具はシンプルで値段もそんなに高くない（ＩＫＥＡとかニトリよりは高いですが）のでおすすめです。都内で、いわゆる商業ビルの中にあるのは以下の店舗です。

unico丸の内店：新丸ビル４階
http://unico-lifestyle.com/ShopInfo/marunouchi/index.html

unico新宿店：ルミネ新宿（ルミネ１）６階
http://unico-lifestyle.com/ShopInfo/shinjuku/index.html

服部家具

ちょっと違うかもしれないけど、西荻窪のアンティークのお店をめぐって探すという手もある。高円寺も似た感じでそういうお店がある。
http://30min.jp/guide/993

ニトリがベストですね、きっと

クラスティーナ
http://www.crastina.co.jp/shop/

KEYUKAは無印よりも上等で郊外も23区内のお店も増えました。
KEYUCA
あと、大きめ店舗のfrancfranは家具やデザイン家電も入ってます。
Francfranc フランフラン
アクタスは入口付近が雑貨やカフェなので入りやすいです。
ACTUS(アクタス)｜インテリア・家具・ソファ・チェア・テーブル・ギフト

すでに何回か上がっていますがニトリがいいと思います。