iOS5以降において顔認証(顔の配置だけでなく本人か別人かを判定する)のサンプルソースコードについて、英語・日本語など問わずご存知の方教えてください。

opencvを利用したiosでのフリーの顔認証コードがあるようです
http://tilomitra.com/architecture-facial-recognition-system/
http://opencv.org/

他、参考になりそうなページ
http://stackoverflow.com/questions/10272129/face-recognition-on-the-iphone
http://stackoverflow.com/questions/10496724/how-to-develop-a-face-recognition-iphone-app
http://www.devbridge.com/articles/face-recognition-ios-christmas-edition

CIDetector クラスによる顔検出のことをおっしゃられているのだと思います。
私なりにロジックを考えてみました。
認証に使用されるということですので、ある程度正面から取った顔写真だろうということを前提にしています。

稚拙な絵ですが、こちらをご参照ください。

吹き出しは CIFaceFeature の属性です。

• 顔の形状
  • bounds.size.width と bounds.size.height の比（丸顔 OR 面長）
• パーツの配置
  • |leftEyePosition.x - rightEyePosition.x| と、bounds.size.width の比（目が離れている？）
  • |bounds.origin.y - leftEyePosition.y| と、bounds.size.height の比（額が広い OR 狭い）
  • |bounds.origin.y - mouthPosition.y| と、bounds.size.height の比
  • |leftEyePosition.y - mouthPosition.y| と、bounds.size.height の比
• パーツの面積
  • leftEyePosition の周囲の適当なエリアに占める黒の割合（目が大きい？）
  • mouthPosition の周囲の適当なエリアに占める赤の割合（唇が厚い？）
  • bounds の上部 20% くらいのエリアに占める黒の割合（髪が薄い？）
  
  

このような値の一致する度合いを比較することで認識率が向上するのではないかと思います。

CIDetector の使い方
http://d.hatena.ne.jp/paraches/20111219
とりあえずこちらが参考になると思います。