まっさらに取得したてのリポジトリなら、ローカルには何も変更が無いという理解なのですが。。 ちなみにブランチとタグがたくさんあるリポジトリです。(関係無いとは思いますが..)
http://qiita.com/hishida/items/35d929845c0ac824b1c0ファイルモードが違っているのかもしれません。
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コメント(4件)
これであればFinderが自動生成するファイルですね。
http://blancbooth.com/archives/62 とかのサイトを参考に作らないようにすることもできますが、弊害もあるので.gitignoreに追加するのが良いかと思います。
リポジトリ内の.gitignoreに追加するとこれはこれで差分になってしまうので、$HOME/.config/git/ignoreに書いておけばよさそうですね。